全称是盟军最高统帅总司令部。英文缩写“GHQ”。是第二次世界大战后1945年至1952年美国以盟国的名义占领日本的最高管理机构，名为盟军总司令部，实际上是美国政府指挥下的美军单独占领日本的总司令部。美国政府于1945年8月13日决定设置盟国总司令部。次日任命麦克阿瑟将军为盟国最高统帅。总司令部最初设在横滨，9月17日移至东京，10月2日开始在日比谷的第一人寿保险公司大楼办公。总司令部机构组成人员由美国人担任，他们只是执行美国政府的对日政策，对盟国的对日政策不加理睬。在总司令部指挥下的盟国占领军共有43万人，其中美军为40万人，其他盟国军队约3万人。

总司令部最初的组织机构中，总司令官下设参谋长和副参谋长，在参谋长下设参谋部和专门部。参谋部中分设参谋第一、二、三、四部，分别担当人事、情报、作战和后勤任务。其中参谋第二部对占领政策的实施有较大影响。专门部中设民政局、法务局、统计资料局、民间谍报局、民间情报教育局、公共卫生福利局、经济科学局、民间通信局和天然资源局等。其中民政局分担占领行政和非军事化、民主化等政治体制改革方面的任务，是推行占领改革的主要部门;经济科学局分担财阀解体和经济民主化的任务;天然资源局分担农地改革的任务;民间情报局分担教育和宗教改革事务。在对日占领过程中，总司令部机构不断扩大，人员超过6000。占领最初两年，专门部增加民间财产管理局、民间运输局、一般会计局、赔偿局等，最多时达到55个局。在司令部之上，设有远东委员会。这是1945年12月美、英、苏三国外长莫斯科会议决定，作为对日占领的决策机构而在华盛顿设立的。由11国代表组成，其任务是制定占领日本政策的基准和原则，监督占领军总司令的行动和指令，实际上只是个徒具虚名、并无实权的组织。作为总司令的咨询机关，还在东京设立由美、英、中、苏四国代表组成的对日理事会，该机构实际上也不过是总司令的装饰品。

盟军总司令部原则上采取对日本政府发出指令，由日本政府实施占领政策的间接统治方式。最初的占领政策根据美国1945年9月22日公布的初期对日政策制定。总司令部除发出书面备忘录指令外，口头指示很多。日本方面在制定预算、法令时必须事先取得总司令部的同意和谅解。占领初期，司令部民政局推行民主改革政策，使日本战后民主改革得以迅速展开。1947年随着国际形势的变化，美国积极推行冷战政策。为了把日本纳入冷战体制，美国对日政策发生急剧变化，很快停止民主改革。民政局的改革派官员陆续被召回美国。总司令部开始在日本推行“赤色整肃”和重新武装日本等政策。1950年朝鲜战争爆发后，麦克阿瑟独断独行干扰了美国对外政策。1951年4月11日杜鲁门总统解除他盟军总司令职务，由李奇微继任。1952年4月旧金山片面对日和约生效，盟军总司令部随即撤销。

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